Em uma Nova Iorque do futuro muito diferente do que conhecemos hoje, uma Tartaruga sobrevivente parte em uma missão aparentemente sem esperanças para obter vingança por seus amigos e família mortos.
A saga O Último Ronin se revelou uma das sagas mais trágicas da histórias das Tartarugas Ninjas nos quadrinhos. Nela, Michelangelo se encontra em uma linha do tempo futurista onde é o único sobrevivente do grupo de jovens ninjas. Ainda assim, luta desesperadamente para levar à paz para uma Nova York controlada pelo Clã do Pé.