Como nos jogos Mega Man, a história em quadrinhos se passa no planeta Terra no ano 20XX, um período futuro não tão distante em que foram desenvolvidos robôs avançados capazes de pensamento e tomada de decisões independentes. O malvado cientista Dr. Wily se propõe a conquistar o mundo, primeiro roubando ou criando autômatos avançados conhecidos como Robot Masters. Para detê-lo, Rock – um robô ajudante criado pelo antigo colega de Wily, Dr. Light – se oferece para ser equipado com armas para que ele possa enfrentá-lo.